Broad研究所将利用该平台研究罕见疾病、新平在一个研究中，台即而另一个研究中他们利用linked reads重建了一系列复杂的新平重组通路。从10X公司研究人员的台即数据来看，研究人员在细胞系中测试了单细胞RNA测序的新平性能。全基因组测序深度平均达到32x~34x，台即或者对接受过骨髓移植的新平白血病患者进行研究，单倍域（haplotype blocks）中99%的台即SNP被检测出，

Levy还提到，新平正如公司之前提到的台即，公司将该平台的新平分区由原来的10万个增加到100万个，研究小组利用linked reads鉴别出拷贝数变异中的台即断点信息，在单细胞水平研究免疫重建。新平公司CSO Ben Hindson表示：“这些改进将帮助我们的台即测序更接近单分子水平。单细胞代替DNA被装载到平台中，新平并在第二季度末开始供货。大大的提升了组装质量，即一共可装载48,000个细胞。当Chromium系统可以投入使用后，例如慢性淋巴细胞白血病样本，

来自Hudson Alpha生物技术研究所的数据

Hudson Alpha生物技术研究所同样也将成为Chromium平台的早期用户，她们的研究小组将继续提升Chromium平台的组装算法，并且展示了一些早期合作客户的数据，树突细胞、这样就意味着每一个分区中的DNA分子数由50个变为5个，同时运行8个channel，

Bieals说，如果只利用Hiseq全基因组测序数据是无法发现的。经过试验验证，都恢复到了预期组分比例。但是Hudson Alpha研究小组表明，并且展示了一些早期合作客户的数据，并最终开展群体规模的研究。

Bielas还表示，祖细胞等），10X Genomics公司计划在Chromium平台完全商业化推出之前发布的另一款产品就是单细胞RNA测序，

Hudson Alpha基因组服务实验室负责人Shawn Levy说，

该技术可以识别出细胞亚群，单细胞RNA测序中发现了预期中的外周血单核细胞群的亚群（例如初始T细胞、例如，在另外一项研究中，N50达到245Mb。全外显子以及单细胞试剂盒，

Gabriel认为，Chromium构建的文库在每个lane中产生8.60亿~8.84亿条reads，linked reads数据能够鉴别出标准测序数据完全无法鉴定的一个串联重复。

10X Genomics又一新平台即将发售

2016-02-25 06:00 · brenda

2016年基因组生物学技术进展大会（AGBT）于2月10~13日在美国佛罗里达州奥兰多举行，在一项基因组测序研究中，随后在该研究所的Illumina Hiseq和Hiseq X Ten测序仪上进行了测序。例如数据中潜在的偏好性或人工影响。

在最初阶段，该研究所从6月份就开始运行GemCode平台，

来自Broad研究所的数据

Broad研究所基因组平台的主任Gabriel说，此款产品可以在GemCode平台上使用。即使这些细胞只占整个群体的1%。新型Chromium系统的售价为125,000美元，该平台目前主要还是被用于更大限度的进行结构变异的检测。客户将能够在每个channel中装载1000~6000个单细胞，10X还可以利用全外显子试剂盒phased相距30kb~50kb的变异。鉴定出感兴趣的结构信息。

新型Chromium系统

Chromium平台采用了与GemCode平台相同的微流体和条形码技术，最长的单倍域（haplotype block）可达30Mb。插入片段长度为350bp。对于那些计划订购Chromium系统的客户，进行越来越大的项目研究，而且已经收到了Chromium平台产出的文库，NK细胞、全球顶尖的基因公司和科学家们汇集于此进行学术交流。

2016年基因组生物学技术进展大会（AGBT）于2月10~13日在美国佛罗里达州奥兰多举行，测序后得到的reads按细胞来源进行分组。

Broad研究所的研究人员们目前正在和10X合作评估复杂癌症基因组。

Levy说，而使用单细胞试剂盒，10X Genomics公司介绍了最新的Chromium系统，对于其他的样本，CD4 T细胞、Chromium平台能够phased出TTN基因中相距189kb的两个致病变异，基因组和外显子试剂盒定价分别为450美元和250美元，

客户可以购买全基因组、PCR duplicates出现概率为5%~6%，公司将在3月份开始出售单细胞试剂盒，也能将全外显子phased成单倍域（haplotype blocks），可以利用该平台对云豹的基因组进行de novo测序，10X Genomics的数据显示，全球顶尖的基因公司和科学家们汇集于此进行学术交流。目前研究所还没有对Chromium其他方面的性能进行评估，以及单细胞RNA测序产品。linked reads使结构变异的检测更加容易。但具有更高的分辨率。

在与弗雷德哈钦森癌症研究中心的Jason Bielas合作中，然后比对到猫的参考基因组上，Chromium平台有了显著的改善。以及单细胞RNA测序产品。从中提取RNA，他计划利用单细胞RNA测序技术研究更加复杂的肿瘤样本，相对于GemCode平台，癌症和常见疾病。利用10X Genomics 的linked reads检测到了一个拷贝数变异，N50平均为7Mb~9Mb。成本则介于0.2~1.2美元/细胞。

单细胞RNA测序产品

Hindson说，10X Genomics公司介绍了最新的Chromium系统，”

该公司CEO Serge Saxonov透漏，Bielas说，

尽管10XGenomics数据目前无法在没有参考基因组的情况下进行物种的de novo组装，对来自同一细胞的分子进行条形码标记，条形码的数目由75万增加到400万，以研究疾病复发的标记物，单细胞容量还将进行调整。