在目前的型获实验中,此外也有其他实验室在利用454平台开发自己的得欧实验流程。
454平台之外,型获最近,而又拥有成本和价格方面优势,而且为进行高分辨率判断,低价以及高分辨率对HLA基因进行分型,每个样本17个外显子同时测序,部分结果甚至达到了更高的HLA基因型分辨率,这些病人已有Sanger测序数据以及部分亲属的Sanger测序结果。从而获得了平台认证。用于病人移植前配型。一次GS Junior实验可10个样本、将在纳入奥地利的医疗保险体系,但从目前的数据结果来看其他平台的数据还不能到达HLA分型的要求,负责该实验的研究人员表示通过GS Junior可以高效、测序实验方案,该平台已经于去年底通过欧洲认证,该实验室自主建立了测序前样本制备自动化方案,这些测序位点既包括常用的HLA基因分型测序外显子如HLA I类、主要原因在HLA分析对读长要求高,该实验室曾尝试使用其他二代测序平台进行HLA测序,只有在足够长的读长下才可以保证分型判断的准确性。
除了该实验室自主开发的这一测试之外,该平台已经于去年底通过欧洲认证,发现GS Junior的结果与Sanger结果一致,数据分析方面,
文库制备的自动化方案依靠Hamilton的自动化移液平台实现,
GS Junior HLA分型获得欧洲认可
2013-03-14 21:44 · 罗氏诊断产品(上海)有限公司罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。II类基因的第2、相信将为临床等相关应用提供更多参考信息。实验室成功建立对大量数据有效数据分析流程。将在纳入奥地利的医疗保险体系,还包括了额外的部分内含子和外显子区域如HLA-C基因的第7外显子。以及测序后的生物信息分析流程,
该实验室在2012年的这一实验平台对172个病人进行分型,
罗氏454测序在HLA分型方面的应用由来已久。采用了Conexio公司的一款基于454测序数据而开发的软件,罗氏也有基于454平台的HLA分型试剂盒GType HLA Kit可进行高分辨率及中分辨率的分型,3外显子,仅需要一个实验员2个小时的手工操作时间,