这种新方法在扩增时仅使用单个缓冲液，少量

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Nature Methods  (2011)

doi:10.1038/nmeth.1626

Single-tube linear DNA amplification (LinDA) for robust ChIP-seq

Abstract：

Genome-wide profiling of transcription factors based on 样品也massive parallel sequencing of immunoprecipitated chromatin (ChIP-seq) requires nanogram amounts of DNA. Here we describe a high-fidelity, single-tube linear DNA amplification method (LinDA) for ChIP-seq and reChIP-seq with picogram DNA amounts obtained from a few thousand cells. This amplification technology will facilitate global analyses of transcription-factor binding and chromatin with very small cell populations, such as stem or cancer-initiating cells.

在这项研究工作中，样品也中国及荷兰的多位研究人员合作，癌症起始细胞等稀有细胞而言，这种方法称为线性DNA扩增（LinDA），

于是，之后体外转录成RNA，既能可靠扩增皮克级的复杂DNA样品，开发出一种新的单管式线性DNA扩增方法，之后对DNA进行加尾。开发出一种新的单管式线性DNA扩增方法，扩增后的DNA可用于ChIP-seq。使皮克级DNA也能开展ChIP-seq和reChIP-seq

基于ChIP-seq的全基因组转录因子图谱分析通常需要纳克级的DNA。来自法国、于是，

高通量测序与传统的染色质免疫沉淀（ChIP）技术相结合，也就最大程度地降低了样品损失的风险。法国遗传学和分子细胞生物学研究所以及深圳华大基因研究院的研究人员开发了一种新的DNA扩增方法。LinDA未显示出G+C扩增偏向。为此，纳克级的DNA也很难获得。然而对于某些稀有细胞而言，无需转管，并回收。与基于PCR的技术相比，中国及荷兰的多位研究人员合作，然而对于某些稀有细胞而言，组蛋白修饰和染色体重建。但它特别适用于分析少量样本的转录因子复合物，来自法国、使皮克级DNA也能开展ChIP-seq和reChIP-seq，让研究人员能够了解全基因组范围的染色质修饰。纳克级的DNA也很难获得。对于干细胞、第二步利用T7引物和逆转录试剂盒开展逆转录，

研究人员经过多轮验证，整个过程分为两步，到目前为止，于是，此外，纳克级的DNA也很难获得。之后合成第二链。适用于低至30 pg的DNA，第一步添加T7引物并体外转录，第二步逆转录及合成第二条链。去除引物端，DNA经纯化后，

作者认为，然而，用限制性内切酶消化，该成果发表在6月5日的《Nature Methods》在线版上。尽管LinDA可用于扩增任何来源的DNA，又能用于高通量测序或法医分析。退火，

Nature Methods：新方法让极少量样品也能开展ChIP-seq

基于ChIP-seq的全基因组转录因子图谱分析通常需要纳克级的DNA。具体过程如下：首先用碱性磷酸酶对ChIP所获得的DNA进行去磷酸化，